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制限酵素は、2本鎖DNAの特定の配列を認識し、 切断する酵素である。 例えば。 「Smal」
という制限酵素は,図1のように 5-COCGGG-3'」という6塩基配列を認識し、 DNA
素地図)を作製したい。 現在、このDNAについてわかっていることは、以下の4点であ
を切断する。今、 図2に示した 25 kbp の長さをもつ線状2本鎖DNA の DNA 地図 (制限酵
る。
① 制限酵素 および制限酵素によってそれぞれの矢印の位置で切断される。
② 制限酵素入で切断して得られる DNA 断片は 10 15 kbp の2本である。
③制限酵素で切断して得られるDNAは7k khpの2本である。
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④ ②で切断して得られるDNA 断片は5kg 9kg 11kbpの3本である。
注1)
Thip, tp 対の数で表したDNAの長さを示す。 kbp=1,000bp
および
注2)
DNAの鎖には一定の方向があり,「5」 および 「3′」 と書いて表す。 ここで
は線状2本鎖DNAを模式的に 5'3' と表す 。
(1)
下の塩基配列をもつ線2本 DNA
されるか その位置を図に矢印で示せ.
Socal で処理した場合、どこで切断
5-ACGGTACCOGGGTAGGTGACCCGGGAAATTCTAGGGCCCATGCTTTGACT-
1111
||||||||||||
3-TGCCATGGGCCCATCCACTGGGCCCTTTAAGATCCCGGGTACGAAACTGA-
(2)
図2に示した 25kbp の線状2本鎖DNAを制限酵素とで同時に切断すると何本
kbp, 8kbp/7kbp
のDNA断片が得られるか、また、それぞれの長さは何kbp か。
(3)図2に示した25 kbp の線状2本鎖DNAを制限酵素 ©が切断するパターンは全部で
何通りと考えられるか。
(4) この25kbpの線状2本鎖DNAを制限酵素人と②で同時に切断すると1kbp, 5kbp,
9kbp, 10kbp の4本の DNA 断片が, 制限酵素とで同時に切断すると2kbp 5kbp, 7
Hip 5p の4本の DNA 断片が得られたこのとき、 制限酵素©が切断する位置はどこか。
考えられる2つのパターンを答えよ。 ただし, 解答は図2を参考にして図示せよ。
(弘前大)
図 1
図2
53
5'
CCCGGG.
3'
•GGGCCC
.5'
min
3'
10kbp
A
15kbp
DNA (25kbp)
5'
3'
53
5'
-CCC GGG-
3'
18kbp
7kbp
3'
-GGG CCC-
5'
B
