消化管は口から始まって、食べ物が通る筋道全ての事です。
主に口･のど･胃･小腸･大腸になります。

一方、消化器官は↑の消化中に関わる臓器全てを指します。
ですから↑の消化管に「食べ物は通らないけど消化には関わる」臓器が追加されます。例を挙げると、胆汁を分泌する胆嚢や、膵液を分泌、膵臓がこれらにあたりますこれらの臓器は「食べ物は通らない」ですが「消化には関わる」ので「消化管」ではありませんが「消化器官」です。