many doctors at the Cleveland Clinic believe
「クリーブランド・クリニックの多くの医師は～だと思っている」

it sends the wrong message (to)
「(to以下)が誤ったメッセージを送る（と）」
※to以下が真主語のit ～ to 構文です

to have fast-food chains such as McDonald’s in their food court
「病院のフードコートにマクドナルドのようなファストフード店を置くこと（が）」

数年前にニュースになったと思いますが、健康食とは言い難いファストフードを病院内のフードコートで提供するのはいかがなものかと考え、マクドナルドだけでなく、ピザハットなどのファストフード店との契約を打ち切った背景があります。