『うんうん』も擬態語です。
とっても簡単に言うと

擬態語･･･音ではない何かの動きや様子を表している
擬音語･･･人間や動物の声を表している

『どんどん』って音だけど声ではないから
拳などで何かを叩く様子を表していると考えます。