どちらが良いという表現には違和感ですが…

θに範囲が決まっていることが多々あります。
以下、aが何か適切な値とします。

sin²θ＝aのとき、
たとえばθが鋭角ならsinθ=√aです。
0°<θ<180°ならsinθ=±√aです。
θが鈍角ならsinθ=-√aです。

超基本概念である、単位円を意識しましょう。

なお、sin²θ＝4となるθは存在しないので、
これは不適切な例です。
これも単位円を踏まえればわかります。