病原菌への応答は、細胞の表面にあるパターン認識受容体（PRR）に、病原体の成分が認識されることから始まります。
PRRが認識すると、核へシグナルが伝わり、PRタンパク質や、ファイトアレキシン、サリチル酸などが合成されます。
PRタンパク質、ファイトアレキシンは、抗菌作用を持ち、病原体へ作用します。
サリチル酸は、他の揮発性化合物の合成を促進し、
この揮発性化合物が、病原体による感染を、他の部位や、他の周辺個体へ遠距離の伝達を行います。