水素結合自体はもう少し低い温度で切れると思います。
PCR法で約95℃にするのは、水素結合が一つではないからです。
AとTは二つ、GとCは三つ水素結合があります。そのため、ほんの少し高くする必要があります。
水（水素結合四つ）の沸点が100℃であることを考えると、水素結合自体は92-93℃程度だと思います。
塩基の割合によって、結合が切れる温度が変わってくるので、必ず約○℃と書いてくださいね。