Whoで始まる疑問文は、

①Whoが主語になる場合
②①以外

の２種類があります。答えが「Tom」だとすると、①の場合は「Tom is./did./does」のようになります。

Who is there? ← Tom is.
Who made it? ← Tom did.
Who likes you? ← Tom does.
Who will come here? ← Tom will.

日本人がよくやる間違いは、「それはトムだよ。」という日本語に合わせて、上のような問いの場合にも「It's ～」とか「This is ～」とやってしまうことです。

さて、①以外の場合は、答え方はいろいろです。

Who is he? ← He is Tom.
Who does she love? ← (She loves) Tom.
Who did you met? ← (I met) Tom.