中枢神経系は、脳と脊髄のこと。脳は体の司令塔、脊髄はその脳と体(たくさんの神経)を繋ぐ役目を担います。ここでは体中から来た情報を処理して、脳が指令を発信します。
そんでもって中枢神経の方は名前通りそのままそこの神経です。なので、ぶっちゃけあんまり違いは無いように思えます…。