通常、PCR法ではDNAヘリカーゼを用いません。
生体内ではDNA複製や転写などの際に、ヘリカーゼがはたらくことで2本鎖DNAの水素結合が切られますが、PCR法ではヘリカーゼを用いない代わりに、温度を上げることで強制的に水素結合を切っています。