まず、このasは接続詞だと思います。

一つ一つ前から読んでいきますね。

bondは動詞にも名詞にもなって、名詞のときは可算名詞にも不可算名詞にもなるんですけど、ここでは
・Newという形容詞がつく
・複数形のsらしきものがつく
というところから加算名詞だとわかります

formも同様に動詞にも名詞（加算も不可算も）にもなるんですが、（formまで見た段階では）特定できないので、候補を整理して後ろを確認してみます
整理すると
① bondsが名詞で、その後ろの名詞formを修飾
② bondsが名詞で主語→formが動詞
です。

①の場合は、主語がform、動詞はjoin upで、
as the atom（であってますか？）は副詞句が挿入されていると考えるしかないので、asは前置詞。
ですが、主語がformなのに、現在形で三単現のsがないのがおかしいから、この解釈は間違いです。

②の場合は、主語はnew bondsで動詞がform。ここまででSVがあって、さらにasより後ろにjoin upという動詞のまとまりらしきものがあるので、
そうするとasが副詞節を作る接続詞で、the atomが主語・join upが動詞（+副詞辞）・in different combinationsが副詞句　となります。

化学かなんかの文章ですかね？
bondsは（化学的な）結合　ってことですよね。
the atomは原子？
combinationsは（物質同士の）組み合わせ　みたいな感じ？