このように、塩基の占める割合を答える問題は、%ではなく、具体的に数値にして考えると分かりやすいですよ
では、このやり方で説明します

説明のため、アデニンが35%、シトシンが25%含まれている鎖の方をE鎖、もう１本の方をF鎖とします。

E鎖ではAという塩基が35%、Cが25%を占めていました。
これを言い換えると、
【E鎖の塩基の数を100個とすると、E鎖においてAという塩基は35個、Cという塩基は25個を占めている】、ということ。
問題は、F鎖においてCの占める割合である。
今回は、E鎖の塩基の数を100個(すなわち、F鎖の塩基の数も100個)として考えたから、問題はF鎖においてCの占める個数を聞かれていることになる。

で、問題文より、2本鎖全体で見ると、Cという塩基が占める割合は20%ということ。
今回は、E鎖の塩基の数を100個として考えているから、2本鎖、すなわち、E鎖とF鎖の合計の塩基の数は200個になる。
2本鎖全体で見ると、Cという塩基が占める割合は20%であった、ということは、言い換えると、　
【2本鎖全体で見ると、Cという塩基は、200×20%=200×0.20=40個だった】、ということ。

2本鎖全体で、Cという塩基は40個占めていて、2本鎖のうちE鎖においてCという塩基が25個、だから、F鎖に存在するCの数は、40－25=15個になる。

よって、F鎖(100塩基)においてCは15%を占めている

分からなければ質問してください