接続詞thatは後ろに完全文が来ますが、関係代名詞は当然後ろに「欠け」があるので不完全文がきます。
The trouble is[ that he doesn't understand you.]
This is so simple <that a child can understand it.>
名詞節を作る場合も副詞節を作る場合もthat節の後ろは完全文です。