X：正しい記述です。
この東アジアの中継貿易にヨーロッパ人が介入したことにより、日本にも外国船がやってくることになります。

Y：誤りです。
海賊取り締まり令により、南蛮貿易は保護・奨励されたので、日本町はむしろ繁栄したと考えられます。日本町が衰退するのは鎖国が原因です。
また、日本町は江戸時代の朱印船貿易によって栄えたものが多いので、江戸時代のキーワードとして覚えておいたほうが良いでしょう。