Δとδはどちらもギリシャ文字で，
Δはδの大文字にあたるのでどちらも同じ文字です。
それはさておき，置く文字は議論の本質と何ら関係しないので，どのような文字で置いても問題ありません。
ただ，ε-δ論法では慣例的にεとδがよく使われるので，実際にε-δ論法の議論をする際にはεとδを使うほうが「親切」ではありますね。