求めている答えかわからないですけど、「呼ぶ」でも「電話する」どちらでもいいと思います。文脈で判断するしかないので。
授業では「電話する」と教えたからそうなってるかもしれません。
補足　「呼ぶ」ならcall A B(AをBと呼ぶ)の形でよく使われます。